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NVIDIA Clara는 AI 기반 의료 연구와 의료 서비스를 가속하는 하드웨어와 소프트웨어를 포괄하고 기술 스택입니다. 이를 이용하면 X-레이, CT, 방사선, 초음파, 자기 공명 등 다양한 의료 영상 처리와 유전자 연구 분야에서 혁신을 가속할 수 있습니다. 의료 분야에 몸담은 데이터 과학자 또는 AI 애플리케이션 개발자는 NVIDIA Clara를 이용해 유전자 시퀀싱, 의료 영상 처리와 분석 등 워크플로우 전반의 속도를 끌어 올려 개발 생산성을 크게 높일 수 있습니다. 

NVIDIA Clara

NVIDIA Clara는 크게 GPU, DGX 서버, CUDA-X 그리고 Clara Genomics, Clara Medical Imagaing으로 구성됩니다. GPU 환경에서 가속의 이점을 누리는 가운데 진단, 처방, 연구 등에 필요한 개발과 분석을 간편하게 할 수 있는 환경입니다.  

유전자 연구의 새로운 장 열어

최근 엔비디아가 유전체 분석을 위한 GPU 가속 기반 라이브러리 모음인 Clara Genomics Analysis SDK를 오픈 소스로 공개했습니다. 오픈 소스로 Clara Genomics Analysis SDK가 공개됨에 따라 알츠하이머, 파킨슨병 등 다양한 유전병의 원인을 찾는 연구 활동이 새로운 전기를 맞이할 전망입니다. 

그렇다면 Clara Genomics Analysis를 활용하면 유전체 연구를 얼마나 빨리할 수 있을까요? Clara Genomics Analysis에는 cudapoa 모듈이 포함되어 있습니다. POA(Partial Order Alignment) 알고리즘을 GPU 환경에서 가속하는 것이 이 모듈의 역할입니다. cudapoa를 사용해 Racon 모듈을 적용한 결과 유전체 정렬 속도가 수십 배 이상 빨라집니다. 참고로 엔비디아에서 향후 파이썬 API를 적용할 예정입니다. 

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