NVIDIA Clara

NVIDIA Clara는 AI 기반 의료 연구와 의료 서비스를 가속하는 하드웨어와 소프트웨어를 포괄하고 기술 스택입니다. 이를 이용하면 X-레이, CT, 방사선, 초음파, 자기 공명 등 다양한 의료 영상 처리와 유전자 연구 분야에서 혁신을 가속할 수 있습니다. 의료 분야에 몸담은 데이터 과학자 또는 AI 애플리케이션 개발자는 NVIDIA Clara를 이용해 유전자 시퀀싱, 의료 영상 처리와 분석 등 워크플로우 전반의 속도를 끌어 올려 개발 생산성을 크게 높일 수 있습니다. 

NVIDIA Clara

NVIDIA Clara는 크게 GPU, DGX 서버, CUDA-X 그리고 Clara Genomics, Clara Medical Imagaing으로 구성됩니다. GPU 환경에서 가속의 이점을 누리는 가운데 진단, 처방, 연구 등에 필요한 개발과 분석을 간편하게 할 수 있는 환경입니다.  

유전자 연구의 새로운 장 열어

최근 엔비디아가 유전체 분석을 위한 GPU 가속 기반 라이브러리 모음인 Clara Genomics Analysis SDK를 오픈 소스로 공개했습니다. 오픈 소스로 Clara Genomics Analysis SDK가 공개됨에 따라 알츠하이머, 파킨슨병 등 다양한 유전병의 원인을 찾는 연구 활동이 새로운 전기를 맞이할 전망입니다. 

그렇다면 Clara Genomics Analysis를 활용하면 유전체 연구를 얼마나 빨리할 수 있을까요? Clara Genomics Analysis에는 cudapoa 모듈이 포함되어 있습니다. POA(Partial Order Alignment) 알고리즘을 GPU 환경에서 가속하는 것이 이 모듈의 역할입니다. cudapoa를 사용해 Racon 모듈을 적용한 결과 유전체 정렬 속도가 수십 배 이상 빨라집니다. 참고로 엔비디아에서 향후 파이썬 API를 적용할 예정입니다. 

새로운 DGX 플랫폼 출시로 코로나19 연구 가속

미 에너지국(DOE) 산하 아르곤국립연구소(Argonne National Laboratory)는 DGX A100 및 엔비디아의 유전체 연구 관련 기술 역량을 활용해 코로나19 백신 개발을 가속하고 있습니다. 현재 이 연구소의 연구원들은 150만 개의 원자로 구성된 코로나 바이러스 표면에 있는 단백질 돌기의 핵심 부위를 시뮬레이션 하는 방식으로 백신을 개발하고 있습니다. 아르곤국립연구소는 미국에서 가장 강력한 슈퍼컴퓨터를 사용합니다. 여기에 더해 24개의 DGX A100으로 구성된 클러스터까지 활용할 수 있게 되어 연구원들은 백신 개발을 앞당 길 수 있을 것으로 기대하고 있습니다.  

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